Festival animovaných filmů se v Třeboni konal poprvé v roce 2002, tehdy se jednalo o národní přehlídku nesoucí název AniFest. Mezinárodní se stala soutěž od svého druhého ročníku. V roce 2010 měl již AniFest 10 soutěžních kategorií.

Od roku 2009 se přesunulo konání festivalu AniFest do Teplic. V Třeboni místo toho vznikl festival Anifilm.

Několik let probíhaly v ČR paralelně dva festivaly animovaného filmu. V roce 2013 ukončil AniFest svou činnost a sloučil se s Anifilmem v Třeboni. První společný ročník se konal v roce 2014.

Mezinárodní festival animovaných filmů Anifilm se koná v Třeboni od roku 2010.