Karel IX. měl podlomené fyzické i psychické zdraví. Vyvraždění hugenotů zejména tu druhou věc dost zhoršilo - král trpěl výčitkami a čím dál více obviňoval svou matku, že jej dohnala k ďábelskému jednání. Zemřel na tuberkulózu dva roky po Bartolomějské noci. François Clouet, Public Domain, https://commons.wikimedia.org/w/index.php?curid=71022338